مخالفت آیت الله منتظری با سفر کمیتۀ تحقیق به لیبی در زمان دولت موقت و لغو سفر این کمیته تنها براى مردم و علماى ايران نگران‌کننده نبود، بلکه علما و مردم لبنان را نيز نگران کرده بود. مرحوم آيت‌الله شيخ محمدمهدى شمس‌الدين، نايب‌رئيس مجلس اعلاى شيعيان لبنان، به نمايندگى از علماى لبنانى نامه‌هاى جداگانه‌اى براى حضرت امام و رئيس‌جمهور وقت ارسال کرد و از ايشان درخواست کرد این کميته هرچه سريع‌تر به ليبى سفر کند و اين تأخير سفر را ضرر به مصالح و کرامت لبنانى‌ها و علما برشمرد.
بعد از لغو سفر کمیتۀ تحقیق دولت ایران به لیبی، مرحوم آیت‌الله شیخ محمدمهدى شمس‌الدین، نایب‌رئیس مجلس اعلاى شیعیان لبنان، در نامه‌هاى جداگانه‌اى به حضرت امام و رئیس‌جمهور وقت درخواست کرد این کمیته هرچه سریع‌تر به لیبى سفر کند.
نامۀ آیت‌الله شمس‌الدین به حضرت امام چنین است:
بسم‌الله الرحمن الرحیم
حضرت امام و رهبر مجاهد و زعیم انقلاب اسلامى
آیت‌الله العظمى خمینى دام ظله
از طرف همۀ علماى شیعۀ لبنان و کسانى که شؤون و مسائل مسلمین را در جبل عامل پیگیرى مى‌کنند. و از طرف همۀ فرزندان مسلمان و شیعۀ شما در لبنان، از شما تقاضا داریم که دستور دهید کمیتۀ تحقیق ایرانى در خصوص قضیۀ فرزند و شاگرد شما، آیت‌الله سیدموسى صدر، به ایتالیا و لیبى سفر کند تا حقیقتى که انتظار براى روشن شدن آن طول کشیده است، روشن شود.
همانا تأخیر این کمیته سبب هتک مصالح و کرامت مسلمانان در لبنان و غیر لبنان است و نیز سبب طولانى شدن جنایتى خواهد شد که به‌اندازۀ کافى، طولانى شده است.
مصالح موهوم سیاسى به این شیوه محقق نخواهد شد. شیوه‌اى که عدالت را قربانى مى‌کند، عدالتى که مستضعفان توقّع دستیابى بدان را از شما دارند.
خوشبختانه انقلاب اسلامى‌ایران به رهبرى شما از منطق «توازن قوا» فرا‌تر رفته است؛ توازن قوایى که همواره مصالح و کرامت مستضعفین به سبب آن تهدید شده؛ توازن قوایى که هیچ‌گاه مصلحت حقیقى را براى اصحاب آن محقق نکرده است.
درخواست خود را از شما تکرار مى‌کنیم و تقاضا مى‌کنیم دستور فرمایید کمیتۀ تحقیق به لیبى برود. چراکه تأخیر آن، ضررهاى فراوانى به قضیۀ مسلمانان و شیعیان در لبنان خواهد زد و آنان را در معرض ضررهاى دیگرى در لبنان و خارج از آن قرار خواهد داد.
به نیابت از علماى شیعۀ لبنان
محمدمهدى شمس‌الدین
نایب‌رئیس مجلس اعلاى شیعیان لبنان
بیروت ۱۴۰۰/۵/۲۸ هـ
۱۹۸۰/۴/۱۴ م
.......
نامه آیت‌الله شمس‌الدین به رئیس‌جمهور وقت ایرانبسمالله الرحمن الرحیم
رئیس جمهور اسلامى‌ایران، برادر ابوالحسن بنى‌صدر
السلام علیکم و رحمةالله و برکاته
از طرف همه‌ى علماى شیعه‌ى در لبنان و از طرف برادران مستضعف شیعۀ شما در لبنان، از شما مى‌خواهیم کمیتۀ تحقیق قضیۀ امام موسى صدر را در زمان مقرر به لیبى بفرستید و این سفر را به تأخیر نیندازید.
تأخیر در فرستادن کمیته، ضررهاى فراوانى به قضیۀ مسلمانان و شیعیان در لبنان وارد خواهد آورد و آنان را در معرض ضررهاى دیگرى در لبنان و خارج لبنان قرار خواهد داد.
موفّق باشید. والسلام علیکم من اخیکم
۲۸ جمادى الشون ۱۴۰۰ هـ
۱۹۸۰/۴/۱۴
محمّدمهدى شمس‌الدین